早年淡水河的水質相當良好，許多河海洄游生物可以大量的上溯到河川中上游。在日據時代相當重視水產資源，在重要的堰壩都設置有洄游魚類上溯所必需的魚道。其中最著名的案例是位於新店溪屈尺的粗坑壩附設有臺灣第一座魚道(興建於1908年)，南勢溪桂山發電廠之桂山壩(1941年完工)附設的階梯式魚道，則可能是日據時代最大型的魚道。前者魚道1990年重修時並未妥善改好，後者又廢棄了，所以等於新店溪沒有任何有效的魚道。
來往於淡水河口到新店溪上游的許多河海洄游魚類，因汙染的關係已經不復見，原生香魚的滅絕便是一例。在新店溪中游的碧潭堰興建已逾40年，過往並未設置魚道，所以對洄游魚類的影響至鉅。
此次碧潭堰重建之際，新北市政府特別委由曾晴賢教授設計全新的魚道，預定112年4月完工，希望屆時可以看到魚類利用魚道上溯的景象。碧潭堰魚道完工之後，除了從賞魚棧道俯視之外，也在魚道的轉彎段設置有透明玻璃的觀察窗，訪客可以平視魚道內的魚游蹤影。
同時也特別裝設水下的攝影機，隨時監測利用魚道的魚群狀況，未來可透過手機掃描QRCode，就能觀看魚道內的生物洄游情形。更利用AI人工智能的辨識方法，來統計經過魚道的魚有多少尾?有哪幾種魚?調查香魚是否回來了等等，兼具學校戶外環境教育的功能。
